Thomas ja muutama muu ovat viimeisiä labyrintistä selvinneitä. Yhdessä Vincen kanssa pieni joukko muodostaa vastarinnan WCKD:iä, tai tuttavallisemmin WICKED:iä vastaan. Vastarinta aikoo vapauttaa WCKD:n julmissa ihmiskokeissa kärsivät maailman helvettiin syösseelle virukselle immuunit nuoret. Kun viimeiseen kaupunkiin viedään Thomasin ystävä Minho, ei alkuperäisestä labyrintistä selvinneille ole muuta mahdollisuutta kuin pelastaa toverinsa urbaanisokkelosta.
Lentomatkustaja nappaa baarin kulhosta pari pähkinää ja ojentaa luottokorttinsa tarjoilijalle. Työpalaveri alkaa kättelykierroksella. Mies yskii täydessä ruuhkabussissa... Nopea kontakti, ohikiitävä hetki, ja tappava virus on siirtynyt eteenpäin. Kun Beth Emhoff palaa työmatkalta Hong Kongista, luulee hän kärsivänsä jet lagistä. Kaksi päivää myöhemmin lääkärit kertovat hänen aviomiehelleen Bethin kuolleen, eikä heillä ole aavistusta miksi. Pian myös muille ilmestyy samoja oireita: yskä ja kuume, sitten aivoverenvuoto ja lopulta kuolema. Sairaustapauksia on ensin yksi, sitten neljä, sitten kuusitoista, sata, tuhansia, kun tartunta leviää rajojen yli ihmiskontaktien välityksellä. Kuolemantapausten lisääntyessä räjähdysmäisesti ja ihmisten kamppaillessa suojellakseen itseään ja rakkaitaan pikku hiljaa murenevassa yhteiskunnassa, eräs bloggaaja synnyttää paranoia- ja pelkoepidemian, väittäessään ettei yleisölle kerrota totuutta siitä mitä todella tapahtuu.
Jotakin kammottavaa on saapunut maapallolle, jotakin, joka hyökkää kimppuumme, kun nukumme, ja muuttaa meidät sieluttomiksi, keinotekoisiksi klooneiksi. Aika käy vähiin, kun psykiatri Carol Bennell Washington DC:stä ja hänen kollegansa Ben Driscoll lähtevät hyytävälle matkalle painajaismaiseen maailmaan, missä ainoa konsti pysyä hengissä on pysyä valveilla.
Biologinen sodankäynti on tuhonnut ihmiskunnan. Tiedemies Robert Neville on saamansa koerokotteen ansiosta selviytynyt sodasta. Nyt hän asuu Los Angelesissa, tuulenpieksämässä autiokaupungissa, jonka hylätyistä tavarataloista hän hankkii elantonsa. Autoja ja muita kulutushyödykkeitä on tyhjässä suurkaupungissa yhdelle miehelle loputtomiin, onhan hän viimeinen terve ihminen. Aina ennen auringonlaskua Nevillen on muistettava piiloutua, koska silloin muut "asukkaat" ilmaantuvat paikalle. Hänen säälimättömiä vihollisiaan ovat sodan runtelemat mutantit, kalmankalpea, valoa aristava uusi "ihmisrotu". Nevillen elämä saa uuden käänteen, kun hän löytää Lisan, nuoren naisen, joka on säästynyt epidemialta. Lisa vie Nevillen piilopaikkaansa, jossa hän tapaa joukon nuoria terveitä lapsia - toivon ihmiskunnan tulevaisuudesta.
Zombiet ovat vallanneet Yhdysvallat, eikä eloonjääneillä ole enää paljoa aikaa. Alcatrazin entiselle vankilasaarelle paenneen ihmisjoukon viimeiseksi toivoksi jää mantereella asuva tiedemies, jonka huhutaan keksineen parannuskeinon zombie-tartuntaan. Ehtivätkö selviytyjät turvaan ennen kuin on liian myöhäistä?
