Presidentti panee vireille ”Ghost Protocolin” ja Kremlin terroripommituksesta syytetyn IMF-agentin Ethan Huntin osaston toiminta lopetetaan. Ilman taustatukea tai apuvälineitä Ethanin täytyy puhdistaa osastonsa nimi ja estää uusi terrori-isku. Ethan joutuu suoriutumaan tehtävästä yhdessä IMF:stä eronneiden agenttien kanssa tietämättä täysin ryhmän motiiveja.
Punaisen Lokakuun metsästys on rankka kertomus kahdesta miehestä, jotka pitävät käsissään tuomiopäivän avaimia. Neuvostoliiton yhdinsukellusvenelaivaston ylpeys, teknologian viimeisintä huutoa edustava Punainen Lokakuu lähestyy Yhdysvaltain rannikkoa kapteeni Marko Ramuiksen komennossa. USA:n analyytikko Jack Ryan uskoo Ramiuksen aikovan loikata. Mutta Ryanilla on vain muutama tunti aikaa löytää Ramius ja todistaa väitteensä oikeaksi, sillä Punaisen Lokakuun jäljillä on myös koko Neuvostoliton ilma- ja merivoimat.
Komedia itsepäisestä armeijan upseerista, joka rangaistukseksi saa komennettavakseen rähjäisessä kunnossa olevan dieselvetoisen sukellusveneen ja surkean miehistön.
Aluksen veteraanikapteeni Frank Ramsey ja juuri virkaanastunut yliperämies Ron Hunter joutuvat suurimpaan maailmanlaajuiseen selkkaukseen sitten Kuuban kriisin. He suuntaavat ydinsukellusvene USS Alabaman kurssin kohti Venäjää, jossa kansalliskiihkoilijat uhkaavat aloittaa kolmannen maailmansodan. Alus vastaanottaa vahvistamattoman käskyn laukaista ohjuksensa. Kaksi eri koulukunnan miestä tulkitsee saman käskyn omalla tavallaan. Aluksella syntyy kapina, jonka lopputulos saattaa vaikuttaa koko ihmiskunnan kohtaloon.
Maailmaa uhkaa ydinsota, ja armeijan vedenalaisen akustiikan asiantuntija yrittää todistaa kuulonsa avulla, ettei kaikki ole sitä, miltä näyttää – tai kuulostaa.
Kapteeni Vostrikov saa komentoonsa Neuvostoliiton laivaston kruununjalokiven, K-19-ydinsukellusveneen. Aluksen neitsytmatkalle kohti Antarktista lähtee myös syrjäytetty ex-kapteeni Polenin. Jännittynyt tilanne kiristyy äärimmilleen, kun sukellusveneen reaktorin jäähdytysjärjestelmä alkaa reistailla amerikkalaisen sotilastukikohdan läheisyydessä.
An MSDF submarine collides with a U.S. nuclear submarine, crushing all 76 people on board, including its CO, Shiro Kaieda. However, the crew survives. The accident is a cover story to get the MSDF submarine's crew on board the Seabat, a nuclear submarine secretly built by the Japanese and U.S. governments. However, Kaieda loads the Seabat with nuclear missiles and suddenly mutinies and flees.
