O cientista Seth Brundle (Jeff Goldblum) testa uma máquina de teletransporte de matéria e inadvertidamente permite que uma mosca entre na câmara junto com ele. Quando se dá a reintegração, o DNA de Seth funde com o do inseto, dando início a uma perigosa mutação genética. A transformação é testemunhada pela jornalista Veronica Quaife (Geena Davis).
Sob uma aparência comum, Martin (Eric Stoltz) é a pessoa mais extraordinária que vive sobre a face da Terra. Apesar de ter apenas 5 anos de idade, ele é um adulto plenamente maduro. E ele também é o filho de uma mosca humana! Agora é apenas uma questão de tempo até os seus genes mutantes acordarem do seu estado de dormência. Com os mais incríveis efeitos especiais, A Mosca 2 é uma sequência inesquecível, tão assustadora e cativante quanto o primeiro filme.
Um cientista tenta criar uma máquina que possa teletransportar a matéria. A sua experiencia no entanto corre mal quando uma pequena mosca entra dentro da máquina juntamente com ele.
Esta história se passa quando Philippe, o filho do cientista Andre Delambre, da continuidade ao trabalho de seu pai. Apesar de seu Tio (Vincent Price) não aprovar as experiências com a máquina de tele-transporte, que deram cabo da vida de seu irmão, ele acaba cedendo e financia seu sobrinho. O que eles não sabem é que a outros interessados na maquina o que leva a um desastre.
Quando os amigos simplórios Jean-Gab e Manu encontram uma mosca gigante presa no porta-malas de um carro, decidem treiná-la na esperança de ganhar muito dinheiro.
Um jovem diretor de cinema está realizando seu primeiro filme, sobre a história de duas garotas que, durante a II Guerra Mundial, são escondidas em uma fazenda para sobreviver. Contudo quando o filme começa a ser montado, o editor descobre, em algumas cenas, a presença de uma estranha mulher de cabelos negros vestindo uma camisola branca, que nào foi vista por ninguém da equipe tecnica durantes as filmagens.
