Contactado por um jornalista, Jason Bourne vai tentar escapar à perseguição de um novo director da CIA, à medida que descobre a existência de um novo programa de assassinos - a Operação Blackbriar - e tenta descobrir mais sobre o seu passado e a forma como se tornou um operativo da CIA.
Um homem é salvo no mar pela tripulação de um barco de pesca italiano. Meio morto e completamente amnésico, não tem qualquer lembrança do passado ou documento de identidade. No entanto, fala várias línguas e possui uma série de conhecimentos de luta e autodefesa que deixam adivinhar um passado perigoso. O homem lança-se então numa busca pela sua verdadeira identidade, ajudado inicialmente pela rebelde Marie - para descobrir quem é realmente e porque motivo tantas pessoas desejam vê-lo morto...
Jason Bourne pensou ter deixado o seu passado para trás, no entanto, está prestes a tê-lo de volta. Há dois anos atrás Bourne deixou o mundo do crime e da espionagem e prometeu retaliação a quem tentasse manter contacto com ele. Agora que esse mundo reapareceu Bourne vai manter a sua palavra. Deviam-no ter deixado em paz...!
